シカート 配列アラインメントに沿って部位ごとのばらつきのプロットを生成する
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シカート 説明

名前Shiatは整列ツールのシャノンの異質性を表します。 SHIATは、シーケンスアラインメント（シャノンエントロピーおよびハミング距離測定を含む）に沿ってサイトごとの変動のプロットを生成します。 このアプリケーションは、DNAまたはRNAアラインメントのシチオンの変動の3つの測定値を同時に計算するための直感的なグラフィカルインターフェースを提供します。 シャノン情報インデックス、ハミング距離、（1合意周波数）はすべて、一連のグラフィックプロットで計算されて表示されます。 複数の整列をインポートして比較することができ、データビューパネルは外部アプリケーションへの簡単なコピーアンドペーストを可能にします。 4つの対策が実装されています。 - シャノン情報エントロピー（ポジション別） - 1-（合意頻度）（位置ごと） - 1-（ヘテロ接合性指数H）（位置による） - ハミング距離（ペアワイズ全体に合計）

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