神経屈折物 3D生物物理的に詳細なニューラルネットワークモデリング
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神経屈折物 説明

神経屈折物は、生物学的現実的なニューロンの複雑なネットワーク、すなわち樹状細胞形態および現実的な細胞膜伝導性を組み込んだモデルの開発を簡単にするために作成された信頼できるアプリケーションです。 それはJavaで実装されており、開発の高度な段階で他のシミュレーションプラットフォーム（PSICS、Moose、Pynnを含む）をサポートして、NeuronおよびGenesisシミュレータのスクリプトファイルを生成します。 MorphML、ChannelML、NetworkMLなど、最新のNeuroml仕様を使用します。このソフトウェアの開発は、ウェルカム信託、医療研究評議会、EUシナプスプロジェクトからの資金調達で可能になりました。 主な特徴： Neurocinstructは、創世記、ニューロン、ニューロル、SWC、およびMorphML形式のモルフォロジーファイルを単一のセルまたはネットワークモデルに含めるために、より手動で組み込むこともできます。 3D に位置するコンダクタンスベースのニューロンのネットワークの作成 ネットワークにセルグループ間の複素接続パターンを指定できます シミュレーションスクリプトは、ニューロン、創世記、ムース、PSICSおよびPYNNベースのシミュレータ用に生成できます（注：すべてのプロジェクトはすべてのシミュレータに対して生成できるわけではありません） 生物物理的に現実的なセルラメカニズム（シナプス/チャネルメカニズム）は、ネイティブスクリプトファイル（* .modまたは* .g）からインポートすることも、ChannelMLを使用してテンプレートから作成された ニューロコ9内のシミュレーションデータとデータの可視化/分析を記録するためのコードの自動生成 記録されたシミュレーションの実行は、シミュレーションブラウザインタフェースを介して表示および管理できます。 Pythonベースのスクリプトインタフェースを使用してモデルの生成と実行を制御でき、セルとネットワークモデルの最適化のために複数のシミュレーションを実行することができます

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