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3dicsi 説明
3DICSIは、化学シフトイメージング（CSI）データを解釈するのに役立つために開発された小型で簡単で使いやすいアプリケーションです。 それは、データの可視化、スペクトル処理、スペクトルの局在化、および推定、スペクトル定量化を、主成分分析（PCA）などの多変量分析手順と組み合わせ、拘束されていない非負行列因数分解（CNMF）。 特に、CNMFは、物理的に意味のある根底にあるスペクトルパターンを回復するための効率的な方法を提供する。 主な特徴： データ入力と可視化： Philips、Ge、Siemens、Brukerスキャナーからの1D / 2D / 3D CSI生データの自動輸入 パラメータを手動で入力することで、未知のデータ型をインポートできます。 サードパーティのプラグインを介して追加のフォーマットもサポートされています。 CSIデータと解剖学的参照画像が登録され、同じウィンドウに表示されます。 各ボクセルは別のウィンドウに表示され、その空間的位置は3つの直交画像ウィンドウで明確に視覚化されています。 1つの向きの画像からの3D画像再構成 多次元スペクトルデータ処理： 定数相と線形位相補正 時間的フィルタリング（ローレンツ、ガウス、または組み合わせ）。 空間平滑化（ハミング、コサイン、フェルミ）。 ベースライン補正 水抑制 PPM原点調整とゼロ充填。 脂質抑制 ピークアライメント。 バッチ処理： 処理ステップのシーケンスをマクロファイルに記録し、CSIデータセットに適用することができます。 バッチモードで同じマクロファイルを一連の試験に適用することができます。 スペクトルの局在化： すべての3次元でリアルタイムマウス促進インタラクティブボクセルシフト 選択された複数ボクセルの平均化。 ユーザのスペクトル推定2D / 3D興味のある領域。 多変量スペクトル分析： CSIデータ・セットに含まれる変動源の主成分（PC）を識別するための、ユーザー定義スペクトル領域とROIの主成分分析（PCA）。 周波数と位相の変動を除去するためのPCAベースの反復ピーク整列手順 身体的に意味のあるスペクトルパターンとそれらの空間分布を回復するための非負マトリックス因数分解（CNMF）法。 スペクトル定量化： エリア統合とPCAを用いた代謝地図生成 ピーク比の生成とユーザ定義領域の生成 参照スペクトルを用いた代謝産物濃度の絶対定量 マップ表示スケール調整は、異なるセット間の比較を可能にします。 ユーザ制御ベースライン補正とのスペクトル統合 データ出力： HTMLフォーマットレポート、CSIスライス、イメージ印刷、ディスプレイコピーおよびペースト機能、スペクトルASCII /バイナリエクスポート、代謝画像の輸出などのさまざまな結果出力オプション。 プログラム拡張性： サードパーティ製のCSIデータの輸入モジュールをサポートするためのプラグイン機構
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