Browser.Berkeley定量ゲノムブラウザ | |
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Browser. 説明
Browserという名前はBerkeley定量的ゲノムブラウザを表します。 BQGBは、ゲノムブラウザの典型的な注釈表示機能の多くが複製されますが、ハイスループットシークエンシングおよびゲノムワイドアソシエーション研究で製造されたカスタムデータと定量的データを重視しています。 アプリケーションは、Webベースのゲノムブラウザの遅い短末日を避けて、ユーザーのデスクトップまたはラップトップコンピュータでローカルに実行されます。 BQGBは、データファイルは、アプリケーションプロセス、およびGFF、ベッド、SGR、WIG、FASTA、またはシーケンスとベースペアの位置の位置を提供する任意の列区切り形式などのファイル形式であることを期待しています。 このトポグラフィは、一般に、多くのカスタムファイルを操作するときに、中央リモートデータベースとWebベースのブラウザのそれよりも高速です。 1つの参照注釈を自分のローカルマシンにダウンロードすることは、何百ものカスタムデータファイルをリモートサーバーにアップロードするより速いです。 閲覧の必要性は変化し、一方の可視化ツールは、高度に局在化されたSNP、近くに近いSNP、近くおよび遠くのCIS規制要素の多様な現象について、高度に発散された種でさえも、遠いトランスの関係に洞察を提供することが期待されるべきである。 BQGBでパッケージされたビジュアライゼーションを超えて、アプリケーションは、分子遺伝的問い合わせの進化の視覚化と探査のニーズに対処する進行中の開発作業を容易にするためのオープンソースのAPIを提供します。
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