JSiteSeScriptor

PDBSから情報を抽出します
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JSiteSeScriptor ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Freeware
  • 出版社名:
  • Kalidas Yeturu
  • オペレーティングシステム:
  • Windows All
  • ファイルサイズ:
  • 580 KB

JSiteSeScriptor タグ


JSiteSeScriptor 説明

JSiteScriptorは、ユーザーがPDBファイルから化学物質と座標情報を抽出するのに役立つツールのアクセス可能なパッケージとして作成されました。 結合部位領域は、グリッドベースのスキームを用いて抽出される。 JSiteSeScriptorは、Javaプログラミング言語の助けを借りて開発された小さなユーティリティです。 主な特徴： バインディングサイトのポケットマッチベースのベクトル記述子の生成 リガンド近傍としてのサイトの指定 - （リガンドコード、名前、チェーンID） PDBサブセットとしてのサイトの指定正規表現を使用している 結合サイトを裏打ちする複数の範囲の原子の指定 バッチモードの処理ファイルはXMLファイルを介して入力パラメータをキャプチャします.XSD仕様 将来の開発のためのシンプルで拡張可能なソフトウェアアーキテクチャ


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