MSATCommander

マイクロサテライトの繰り返しを特定し、遺伝子座特異的プライマーを設計し、タグをタグ
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MSATCommander ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • GPL
  • 出版社名:
  • faircloth
  • オペレーティングシステム:
  • Windows All
  • ファイルサイズ:
  • 5.7 MB

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MSATCommander 説明

MSATCommanderは、Microsatellite(SSR、VNTR、C)を見つけるために書き込まれたPythonプログラムです。 MSATFINDERは、すべてのDI - 、TRI - 、TETRA-、PENTA-、およびHEXA - ヌクレオチドの繰り返しを検索します(オプションは、繰り返しタイプ、繰り返し型の組み合わせを検索するためのオプションを使用して)。 MSATCommander Aを与える能力を完全に評価しよう! 主な特徴: 全てのモノ - 、ジ - 、トリ - 、テトラ、ペンタ - 、およびヘキサヌクレオチドの繰り返しを検索する 繰り返しは、ユーザー指定の距離(BP)で組み合わせることができます 配置繰り返しのためのプライマーを設計する M13R、CAG、またはカスタムタグを使用してプライマーをタグとテストします。 「最良の」プライマーがユーザーに報告されます gttt ittt imtailsをun-taggedの「ベスト」プライマーにユーザーに報告されています は、大多数のユーザーのための便利なGUIを提供しています スプレッドシートソフトウェアを簡単にインポートするために、CSV形式の出力を出力します


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