| orfprimer. プライマーデザインはこのJavaツールを介して簡単に |
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orfprimer. 説明
Orfprimerは、自動プライマーデザイン用に特別に作成されたJavaベースのソフトウェアです。 これは、Genbank XMLおよびFASTAシーケンスフォーマットを読み取る以前にリリースされたソフトウェアORFERに基づいています。 タンパク質配列は、通常、対応するタンパク質標的のGI識別子またはアクセッション番号を単に指定することによってダウンロードされる。 ORFERは、要求されたタンパク質シーケンスからオープンリーディングフレームを抽出し、それを表示します。 orfprimerは、これらの配列についてPCRプライマーを自動的に計算します。 Orfprimerの処理は、デフォルト設定を使用して直感的で非常に簡単です。 さらに、次のようなプライマーの計算以降の計算オプションを変更するための多くの可能性を提供する可能性があります。 ・プライマー位置のシフト、 ・所望の融解温度の変化 ・プライマー配列中の制限部位の変化。 このようにして、Orfprimerは、それを強力なソフトウェアツールにする1つのプログラムでの利便性と適応性を兼ね備えています。
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