アレイデザイナー Array Designerは、SNPジェノタイピング用のマイクロアレイを作るために、何千もの効率的で高度に特定のオリゴを設計するのに役立ちます。
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アレイデザイナー 説明

Array Designerは、SNPジェノタイピングのマイクロアレイを作るために、何千もの効率的で高度に特定のオリゴを設計するのに役立ちます。 ArrayS Designerプロジェクトは、ボタンのクリックでSNPジェノタイピングおよび発現研究のためのマイクロアレイを作るための何千もの効率的で高度に特定のオリゴを設計するのを助けることができます。後処理時代の遺伝子管理要素を調査するために、ソフトウェアは内科関節を問い合わせるためのタイリングアレイを設計します。遺伝子間領域と今ソフトウェアはまた、臨床試験集団内の大きなゲノム配列の分析のための再配列配列を設計する。 "Array Designer"の主な機能はいくつかあります。 ・オリゴマイクロアレイソフトウェア：Array Designerは、SNPジェノタイピングと発現研究のための高度に特異的なオリゴマイクロアレイを設計しています。 ・OLIGOマイクロアレイデザインソフトウェアは、発現とSNPの研究のためのプローブを設計するのに役立ちます。 ・アレイデザイナは、大規模プロジェクト用のオリゴ/プライマーを設計するための非常に柔軟でスケーラブルなマイクロアレイソフトウェアです。 ・アレイ設計者は、マイクロアレイ実験のための高度に特異的なオリゴヌクレオチドプローブを設計するための高スループットの大型のアプローチを提供するマイクロアレイソフトウェアです。 ・cDNAマイクロアレイ設計：アレイデザイナデフォルトでは、cDNAマイクロアレイデザインのための最適化された設計パラメータを使用します。 ・DNAマイクロアレイデザインのために、慎重に選択されたデフォルトパラメータはデザインを成功させるのに役立ちます。 ・高度に洗練されたアルゴリズムを備えたアレイデザイナは、マイクロアレイデザインのための最高のDNAマイクロアレイソフトウェアであり得る。 ・全ゲノムアレイ全ゲノムアレイは、両方のゲノム鎖に遺伝子発現を同時にモニターすることができるので、天然アンチセンス転写物の十分に理解されていない局面を研究するのに有用である。 ・タイル配列アレイは、遺伝子の上流であるだけでなく、イントロン領域および遺伝子間領域においても転写因子結合部位TFBSを調べるために使用される。 ・並列配列 - 標準的なプローブに加えて、アレイデザイナーはまた、臨床試験集団内の大きなゲノム配列の分析および遺伝的変異のために有用な再配列アレイを設計する。 ・柔軟な入力フォーマット - GenBank、Fastaのシーケンスをサポートします。単一のGenBankまたはFASTAフォーマットファイルから複数のシーケンスをロードします。 ・標準PCR反応条件 - 全ての配列上でPCRプライマーを最適化して均一な反応条件で増幅する。 ・複数のプローブ - 検出精度を高めるために、シーケンスごとの最良プローブまたはシーケンスごとに複数のプローブを設計します。 ・SNP検出 - ハイブリダイゼーションとプライマー伸長検出の両方のSNPプローブを設計します。 ・フレキシブルハイブリダイゼーションプローブ位置 - プローブは各サイトにまたがるように設計することも、各サイトに固定されている3 '末端を持つことも、サイトの周囲の指定された領域内で最適化することもできます。

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