lutefiskxp. LuteFISKXPは、タンデム質量スペクトルからの新しいペプチド配列決定を行うために使用されるANSI C準拠のソフトウェアです。
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lutefiskxp. 説明

LuteFISKXPは、タンデム質量スペクトルからの新しいペプチド配列決定を実行するために使用されるANSI C準拠のソフトウェアである。 LuteFISKXPは、タンデム質量スペクトルからの新しいペプチド配列決定を実行するために使用されるANSI C準拠のソフトウェアである。 Lutefiskは、ペプチドCIDスペクトルのDE NOVO解釈のためのソフトウェアです。正確なデータベースの一致を行うことができないペプチドの高品質のタンデム質量スペクトルがしばしば得られる。種間の変異、データベース配列誤差、または予期せぬタンパク質分解的切断など。この問題の取り組みを開始するには、コンピュータプログラムLuteFISKを使用してCIDスペクトルのDE ofplointationを実行します。しかしながら、任意のそのような解釈はほとんど常に複数の配列候補を生み出し、そこで正しいシーケンスを誤ったものと区別することが困難であるか不可能である。候補配列間の変動はしばしば軽微で、典型的には同じ質量のジペプチドの交換を含む。 、同じ質量の単一アミノ酸を有するジペプチドの置換、および同じ質量のジペプチドによるアミノ酸の置換。 2番目のプログラムのクエリシーケンスとしてLuteFISKによって生成された複数のシーケンス候補を使用します。 Cidentifyは、マルチクエリシーケンス、あいまいなジプセプチド、アイソバリア質の質量ALIXAFTER.COMPILEのようなMSニュアンスを収容するBill PearsonのFastaのFASTAアルゴリズムで、アーカイブを解くUnixAfterでは、システムのメイクファイルを「MakeFile」にコピーします。 "make lutefisk" command.usage：lutefisk -O =出力ファイルpathname -q =クワイトモードオン（デフォルトオフ）-m =前駆イオンマス-d = detail file pathname -p = paramsファイルpathname -r =残余ファイルpathname -s =データベースシーケンスを持つファイルのパス名-v = verboseモードオン（デフォルトオフ）-h =このリリースでは、このリリースでは新機能：・更新されたメイクファイル

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