オリゴチェック ランキングとまとめ
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オリゴチェック 説明
OligoCheckは、潜在的な標的配列を有する塩基間ミスマッチの数が増加するにつれて、プライマーセットまたはプローブの系統の系統を評価することによって、頑健性を評価するために設計されたJavaベースのツールです。 ユーザは、核酸配列のデータベースと共にチェックするためにプライマーセットまたはプローブを供給する。 OligoCheckは、データベース内の各関連レコードに対してプライマーセットまたはプローブをチェックし、一致が許可されている数の不一致の数が増えているかどうかを注意してください。 結果の分析は、シーケンスレコードデータと並んでグラフィック形式で表示されます。 核酸プライマーセットおよびプローブが正しい核酸配列に排他的に結合する能力は、特定の系統発生基の正確な標的化に基本的である。そのような特異性は、これらのオリゴヌクレオチド標的の核酸配列の領域の一意性に大きく依存する。 よりユニークな領域は、より頑丈であり、より頑丈では、アニーリング温度および他の生化学的に関連性のあるパラメータの変動が、1つまたは複数の塩基差を有する標的と首尾よく結合するオリゴヌクレオチドをもたらすとしても、意図された標的に対してのみアニールすることになる。 したがって、堅牢なプライマーセットまたはプローブは、1つまたは複数のミスマッチが許容されていても、意図されたターゲットに排他的にアニールするものとして見ることができる。
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