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訪問 説明

訪問者は、ネットワークと経路の分析を手助けするように特別に設計されたユニークで便利で使いやすい、簡単なアプリケーションです。 VisantはJava開発言語を使用して書かれています。 主な特徴： ネットワークモジュール濃縮分析（NMEA）2つのデータセット間の表現型差（例えば、疾患の遺伝子発現）を検出し、P53変異体データの細胞周期経路についてNMEAを試してみる。 NMEAは、表現型の違いを知らせる機能的モジュールを見つけるために決定されます。現在の放出のために、そのような違いは通常転写活性である。 NMEAはデフォルトですべての組み込みのメタノードに対して実行されます。この機能は式メニューの下にあり、式データの入力（表現データ）を入力する必要があります。 NMEAの実行が完了すると、モジュール内のノードはそれらの濃縮スコアに従って着色されます ネットワークモジュールの過剰表示されたGO用語を見つけるために、濃縮時の分析（GOTEA）を求めます。この機能は、メタグラフメニューの下で利用可能であり、注釈が付けられているモジュール内の遺伝子が必要です。 バッチモードは、インタラクション、名前解決、およびGOアノテーションのデータベースクエリを自動化します。 バックアップモードバックグラウンドでバッチプロセスを自動化し、大規模なネットワークを数百万ノードとエッジで処理します。 メタグラフ：機能モジュールのネットワークに最適なバイオネットワークのマルチスケールビジュアライゼーション インタラクション統計情報を介した大きな相互作用データセットの高速バッチ負荷 ネットワークの柔軟なビジュアルスキーマ：カスタマイズされたNodeEDGEアノテーション、 統合データマイニング：405K +機能的協会（実験：98924、計算：307017）、酵母、Fly、Homo Sapiensなどの名前正規化、 調整可能な高性能、大規模ネットワークをサポートし、226K +エッジとノードでテストが行われました。 高解像度SVGのネットワークへのリンクと組み込みサポートを簡単にリンクする ネットワーク/ Pathwayの表現オーバーレイ 同じ経路/複合体/ネットワーク内の遺伝子のための統合式データベース推奨システム KEGG経路の探索的なナビゲーション エッジ厚さ、またはエッジカラー、またはその両方を使用した加重ネットワークのサポート。

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