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Blast2Go. ランキングとまとめ
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Blast2Go. 説明
Blast2Goは、シーケンスとシーケンス分析に注釈を付けることを可能にする強力なプログラムです。ソフトウェアは、シーケンスの機能的注釈のための包括的なツールを提供するため、BioInformaticsフィールドに適したソリューションです。言い換えれば、タンパク質シーケンスの生物学的機能に関する情報を添付することができます.Data分析、注釈とGraphSblast2goはあなたに複雑なデータ分析を実行する可能性を提供し、次いで遺伝子またはタンパク質配列の挙動に関する科学的な情報を追加します。これはJavaベースの独立プラットフォームです。これにより、包括的なデータ分析を実行できます。ソフトウェアはオンラインデータベースまたは情報のライブラリにアクセスでき、データを比較または追加することができます。 さらに、それはすでに分析されたデータから類似のセットに機能ラベルを転送することによって、大規模なデータセットの迅速な注釈を容易にします。このアプリケーションには、統計分析やデータの視覚化のためのいくつかのツールもあります。 アプリケーションは、大規模な一連の注釈を追加して統計的チャートを生成する前に、Blast Tests、Interproスキャンまたはデータマッピングを実行できます。ウィンドウの下部の情報パネルは、分析結果だけでなく、並列に実行されているいくつかのプロセスの進行状況を示します。 DataBlast2Goのロード、分析、エクスポートを使用すると、プロジェクト、シーケンス、分析結果、遺伝子記号、または注釈を簡単にエクスポートすることができます。分析はオンラインサービスとの比較を意味します。例えば、タンパク質芽細胞は、雲芽細胞、NCBI、AWSまたは局所的な芽球を介して行うことができる。また、各シーケンスについて、利用可能なアプリケーションまたはBlast Hitsのマッピングを使用して、InterproScanを実行することもできます。 注釈プロセスは、E値ヒットフィルタ、HSPヒットカバレッジ、または計算分析の証拠コードなど、いくつかのパラメータを設定することを意味します。シーケンスに注釈を付ける結果は、メインインターフェイスに、長さ、ヒット数、E値、SIMの平均、GOヒット、GOリスト、酵素リスト、およびInterProスキャンの下で表示されます。 チャートと分析結果Blast2Goは、メインテーブルの下の領域で、タブ付きビューで一連のチャートを表示できます。配信チャートは、E値、シーケンス類似性、種などのために生成することができる。さらに、各シーケンスエントリはデータソースを示すためにテストを保留中に自動的に色付けされます。本ソフトウェアは、実験により、遺伝子およびタンパク質の挙動を研究するバイオエンジニアのための適切なツールである。 Elizabeta Virlanによってレビューされ、最後に2014年12月23日に更新されました
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