pr Parsimonyラチェット解析が簡単になりました。
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pr 説明

Paupは、パーシモニーと尤度ラチェット分析であなたを助けるために特別に設計された便利なアプリケーションです。 PRAPは、Parsimony Ratchet Algorithmを使用してブライマーサポート（BS、Decay Values; Bremer 1988）の計算を可能にします（Nixon、1999）。 あるいは、BSもラチェットを使用せずに計算することができる。 さらに、ラチェットが単一の一連のサイクルで動けなくなるというわずかなリスクをさらに低減するために、ランダムな追加サイクルを公開されたラチェット手順に重ね合わせることによっても、単純なパーシモニーラチェット検索をPRAPで実行することができます。 ここでは、一連のラチェット反復（一般に約200回の反復）が異なる出発木から繰り返し開始され、これらすべての反復シリーズから最短の木が収集されます。

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