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sbmlsqueezer. 説明
SBMLSqueezerは、各反応の文脈に従って生化学的ネットワークのための速度論的方程式を生成します。 CellDesignerのプラグインとして使用されると、すべてのネットワークコンポーネントのSBGN表現から情報が使用されます。 スタンドアロンモードでは、SBMLSQuezerはシステム生物学オントロジー（SBO）注釈を評価してこの情報を抽出します。 SBMLSqueezerによって生成できるレートの法則には、いくつかの種類の一般化されたマスアクションが含まれます。詳細で一般化された酵素速度論、さまざまな種類のヒル方程式、S-およびH-Systems、および遺伝子調節のための添加剤モデル。 ユーザー定義設定は、任意のタイプの反応に適用する式と、モデルのユニットの一貫性を保証する方法を指定します。式は、コンテキストメニューを使用して作成できます。 すべての新しく作成されたパラメータには、派生ユニットが装備されており、利用可能な場合はSBOの用語で注釈が付けられています。 MathMLはSBMLファイルに直接挿入されます。通常の微分方程式のラテックスまたはテキストの輸出が提供されています。 SBMLSQueezer Aを提供してください。
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