エストスカン

それらが低品質であっても、DNA配列中のコード領域を検出する
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  • Christian Iseli
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エストスカン 説明

たとえそれらが低品質であっても、DNA配列中のコード領域を検出する EstScan Projectは、たとえそれらが低品質であっても、DNAシーケンスのコーディング領域を検出できるプログラムです。 EstScanはまた、Frameshifts.estScanにつながるシーケンスエラーを検出し、修正することも、オープンリーディングフレーム検出器でもありません。実際、その強さは、符号化領域を検出するためにオープンリーディングフレームを必要としないという事実にある。結果として、プログラムは、NまたはC末端のいずれかでいくつかの翻訳されたアミノ酸を見逃すことがあるが、高い選択性および感度を有するコード領域を検出するであろう。コーディング領域このバイアスは、不均一な3周期式5次隠れマルコフモデル(HMM)として形式化されています。さらに、ESTSCANのHMMは、コーディング領域の統計を改善するときに挿入および削除を可能にするように拡張されています。このリリースの新機能: ・MakeMATプログラムで誤った入力を誤ってクラッシュさせ、潜在的に有用なエラーメッセージを提供するようにすることで、いくつかの健全性チェックを追加してください。


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