CLCメインワークベンチ ユーザーが多数の高度なタンパク質配列を分析することを可能にするソフトウェア環境
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データ管理 ワークベンチ タンパク質配列 タンパク質分析 CLC 併せた

CLCメインワークベンチ 説明

ユーザーが多数の高度なタンパク質配列を分析できるようにするソフトウェア環境 CLC Main Workbenchは、スムーズなデータ管理と組み合わされ、優れたグラフィカル表示と出力Options.CLCメインワークベンチが、Linux、Mac OS X、およびWindowsプラットフォームに優れたグラフィカルな視聴および出力Options.CLCメインワークベンチがあります。 "CLC Main Workbench"の主な機能はいくつかあります。 プロジェクトとデータ管理： ・データ入力、データ管理、計算結果、およびデータ輸出の完全統合 ・詳細履歴ログ ・すべての種類のファイルをローカルプロジェクトに保存し、プログラムから起動できます。 ・多数のファイルフォーマットでデータのインポートとエクスポート ・一度に複数のアクティブなワークスペースで作業するオプションが複数のプロジェクトで同時に作業を可能にする ・標準クロマトグラムフォーマット、ABIフォーマット、PHDフォーマット（Phred）を用いた自動DNA順序機器からのトレースデータファイルと品質スコアのインポート Protein Workbenchのバイオインフォマティクス機能： ・アルファヘリックスおよびベータシートは、シーケンス上の注釈として示されています。 ・3D分子ビュー ・Transmbrame Helix予測 ・抗原性 ・二次タンパク質構造予測 ・PFAMドメイン検索 ・シグナルペプチドのウェブベースの予測とそれらの切断サイト（SignalP - 利用可能な最良のツール） ・疎水性分析とグラフ ・タンパク質電荷分析とグラフ ・タンパク質から遺伝子への逆翻訳（多数の翻訳表） ・DNAとRNAのタンパク質の相互翻訳（単一配列とアラインメントの両方） ・タンパク質透過性検出 ・タンパク質統計の報告（各レポートの1つ以上のタンパク質） ・1つの文書内の蛋白質分析の範囲を含む包括的な報告 ・統合ユニプロット検索（Swiss-Prot / Trembl） ・UniprotおよびNCBIデータベース内のシーケンスデータのWebベースの検索、およびGoogle Gene Workbenchのバイオインフォマティクス機能： ・円形分子の柔軟な見方 ・グラフィカルおよびアルゴリズム的に高度なプライマーデザインのための編集者 ・DNA配列データの組み立て ・分子クローニング ・シーケンスの自動SNPアノテーション ・DNAパターンの検索と発見 ・局所複雑度領域解析 ・多数の種の翻訳表に基づくタンパク質から遺伝子への逆翻訳 ・高度な制限酵素分析と管理 ・ドットプロットベースの分析 ・所与の分子の特性を含む短い形DNA統計 ・NCBIシーケンスデータ検索 ・PubMedからWeb情報へのアクセス その他のバイオインフォマティクス機能 ・線状分子と円形分子の両方を表示するDNA、RNAおよびタンパク質配列エディタ ・DNA、RNA、およびタンパク質アラインメントエディタ ・DNA、RNAおよびタンパク質アラインメントの両方に沿った対話型ロゴ ・1回のワークステップにおける複数シーケンスに対する分析のバッチ処理 ・Motif Search. ・パターン発見（不明パターン） ・高度な再配置と固定点位置合わせオプション ・DNA、RNA、およびタンパク質アラインメントに沿ったシーケンスロゴグラフ ・シーケンスの手動注釈 ・統合PUBMED検索 ・BLASTを使用したWebベースのシーケンス検索 ・ドットプロットベースの分析 ・局所複雑度領域分析と複雑さプロット ・ギャップ分数グラフ ・G / Cコンテンツ分析とグラフ 表示と報告： ・高度なブラストビュー ・高度なグラフビュー ・高度なヒストグラムビュー ・高度なドットプロットビュー ・シーケンスとアライメントの特性を検索します 要件： ・256 MBのRAMが必要です ・512 MB RAMをお勧めします ・1024 x 768ディスプレイをお勧めします 制限事項 ・4週間の完全に機能的なデモ

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