ファミド

このツールを用いてDNA配列を分析する。
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ファミド ランキングとまとめ

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  • Rating:
  • ライセンス:
  • Freeware
  • 出版社名:
  • Philipp M. Schluter
  • オペレーティングシステム:
  • Windows All
  • ファイルサイズ:
  • 987 KB

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ファミド 説明

DNAフィンガープリント(AFLP、RAPD、ISSRなど)の研究は、その技術に関連するノイズであるかどうか、またはスコアリングなどに行われたエラーであるかどうかに本質的に不確実性をもたらします。 あなたは、非公開/存在(0/1)を使用してデータを獲得することができます。つまり、あなたが欠席とプレゼンス(保守的であること、おそらくプレゼンスではなく欠席する)について、データポイントを分割しようとすることを意味します。 あるいは、不確実性を許可することができます。(0 /?/ 1)。これにより、後であなたのデータを2番目の外観を持つことができ、このあいまいなデータや欠けているデータがあなたの分析にあるかもしれません。 あなたがそれをやっているのを助けるために、FAMDは少し、使いやすいアプリケーションです。具体的には、欠けている(またはあいまいな)データのアドレス指定、FAMDは次のように実装しています。 ・最小/最大/平均(DIS)類似性計算により、欠落データが分析に影響を与える可能性がある程度の推定を可能にする。 ・Jaccard's、Dice、SMC類似性、ニリおよびユークリッド距離 ・距離行列の出力 ・データが不足しているリサンプリング ・ブートストラップによるシャノン索引の推定。 ・UPGMA、NJ、厳格および多数決のルールの合意の木 ・Rサポートの推定 ・ビットマップとメタファイルサポート付きPCOA(主座標解析)と3Dビューア ・AMOVAすべて実装された(DIS)類似性尺度 ・Nexus、Arlequin Project、Hignex、Hickory(Nexus Alleles Block)、GenePop、NTSYSPC、Structure、Hignexなどのフォーマットへのデータのエクスポート。 ・人口ヌル対立遺伝子周波数のベイジアン推定と個体間距離の計算


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