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treef 説明
進化的な木は、集団間の遺伝的関係を説明するために頻繁に使用されます。階層的な分岐木は、DNA配列や種の進化のための合理的なモデルですが、遺伝子の流れによって結合した集団の集団構造を説明するのに適しているかもしれません。 例えば、集団がステッピングストーンパターンに配置されている場合、個体群間の遺伝的関係は階層的パターンに従わず、そして伝統的な隣接接合またはupgma木はそのような集団の構造を説明するための適切なツールではないかもしれない。 TreeFitは、ツリーがどの程度のツリーがどの程度の木から計算されたかを分析するのに役立つ簡単なアプリケーションです。 TreeFitは、遺伝的距離行列から隣接接合とupgmaの木を作成し、それから人々の間の観察された遺伝的距離を木の遺伝的距離と比較します。これらの距離間の類似性は、R四方の回帰回帰線の周りの点の散乱を要約するために使用される身長統計である。
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